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NEWS开拓创新:尊龙凯时以摩尔浓度可视化长读序列DNA质控
来源:窦红力 日期:2025-03-10尊龙凯时的核心观点提炼:质量 vs 摩尔浓度
在长读长基因测序中,质量控制的重点应更多地关注样本的摩尔浓度,而非单纯的质量。传统的质量控制方法往往侧重于质量分布(例如,通过RFU值进行测量),但在处理长读长测序样本时,这种方法存在一定的局限性。因为测序读取数与DNA片段的摩尔浓度呈正比,长片段的有效测序率在短片段的干扰下可能受到影响,从而导致数据质量下降。
尊龙凯时的FemtoPulse系统展现出明显优势:相较于传统方法,FemtoPulse系统提供的摩尔浓度视图不仅消除了由质量引起的偏差,还能够为长读长测序提供更为精准的结果预测。该系统结合ProSize数据分析软件,以摩尔浓度而非质量为单位进行样本可视化,帮助研究人员更准确地评估样本的测序潜力。
在基因组学研究中,尤其是在长读长测序的背景下,样本的质量控制是确保数据可靠性的关键步骤。FemtoPulse系统可自动化进行DNA脉冲场电泳分析,并通过ProSize软件所提供的精准数据分析,切换电泳图的Y轴单位,从质量(ng/μL)到摩尔浓度(nmol/L),以此提升分析的精度。这种方法使得研究者能更有效地利用DNA片段的摩尔浓度进行样本评估。
例如,在FemtoPulse系统的帮助下,经过Sacl酶切的Lambda DNA样本显示,在传统质量视图中尽管三个片段的摩尔浓度相似,较短片段的峰高明显低于较长片段。然而,使用摩尔数进行展示后,这种差异将不复存在,从而提供了更加均衡的数据视图。
Smear分析是长读长测序准备中至关重要的一环。FemtoPulse系统能够定量不同大小区间内的DNA片段摩尔浓度,协助研究者判断是否需要进一步进行片段筛选步骤。这对优化文库准备流程、提升测序效率尤为重要。在实际样本分析中,FemtoPulse系统能够揭示出在传统质量视图下难以察觉的小片段在样本中的摩尔浓度,从而避免这些小片段在测序过程中被优先读取,影响整体测序的质量。
总而言之,尊龙凯时的FemtoPulse系统在长读长测序样本分析中,通过摩尔浓度可视化提供了一种更为精确的工具,助力研究人员优化样本准备流程,提高数据质量,并为测序结果的预测提供有力支持。
关于尊龙凯时的FemtoPulse系统:它为高分子量DNA样品的高准确度分析提供了出色的解决方案。该系统利用脉冲场电泳技术,能够为高达165kb的DNA样品提供精确的定量和定性分析,这对于评估长读长测序文库的质量至关重要。与其他基于非变性凝胶的分析仪器相比,FemtoPulse系统具有极高的灵敏度,能够检测低丰度样品,是进行高灵敏度RNA或cfDNA样品分析的理想工具。
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